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分子动力学 与第一性原理

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#楼主# 2019-9-18

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分子动力学及第一性原理   https://share.weiyun.com/56VAbyF
三个课程,每班每人¥4300元(含报名费、培训费、资料费),食宿费用自理。
9月30日之前汇款优惠400,10月12日之前汇款优惠200,名额有限;如需开具会议费的单位请联系招生老师要会议邀请函;
详情咨询科宇老师:13520456594(微信同号),QQ1446084643
“LAMMPS分子动力学模拟技术与应用”2019年10月31日——11月04日 北京
第一天上午  LAMMPS基础        
1  分子动力学模拟入门理论——掌握lammps的in文件中各命令的意义
第一天下午   LAMMPSS入门学习        
2   LAMMPS入门操作基础  实例操作:编译安装自己的LAMMPS可执行程序。
第二天上午LAMMPS进阶学习        
第三天3. LAMMPS各种参数计算   实例操作:学员结合自己的科研方向,选择运行契合自己研究方向的例子
第二天下午  Lammps的建模1        
4. LAMMPS建模——掌握基本操作流程
实例操作:MS建立环氧树脂/二氧化硅模型,并转换成lammps的data文件
第三天 上午  Lammps的建模2        
4   LAMMPS建模——掌握基本操作流程
实例操作:把上述实操模型转换成lammps的data文件
第三天下午  从examples的简单例子,到完成自己的科研课题        
5 通过examples中的例子,理解要模拟对象的物理意义
第四天 上午  夹层结构(graphene/C60/graphene)摩擦性质模拟
(AIREBO力场)        
6  夹层结构(graphene/C60/graphene)不同粗糙度条件下的摩擦性能研究
第四天下午  环氧树脂在二氧化硅表面吸附模拟(CVFF力场)        
7 环氧树脂在二氧化硅表面吸附吸能的影响

“GROMACS分子动力学模拟技术与应用”
2019年10月24日——10月28日  北京

第一天上午   GROMACS基础        
1 分子模拟入门理论——对分子动力学模拟原理游刃有余
第一天下午GROMACS入门操作        2 GROMACS入门操作基础
3 GROMACS建模——掌握基本操作流程——使学员具有扎实的技术基础
第二天上午GROMACS建模计算        
4 GROMACS计算实例——熟练掌握GROMACS计算一整套流程
5 使用AmberTools建立分子GAFF力场(力场的精确构建方法)
第二天下午   GROMACS初级数据分析        
6  GROMACS数据分析
第三天上午   复杂体系建模分析        
7 蛋白体系、生物大分子建模仿真
8 复杂体系建模仿真:蛋白配体复合物
9 伞形采样——计算结合自由能
10 使用g_MMPBSA计算结合自由能
11表面活性剂构建和模拟
12生物膜构建和模拟
13 固/晶体建模仿真
第三天下午   数据分析        
14  GROMACS高级分析工具运用
15 分析轨迹代码编写
第四天  专题讲解
专题一:非标准残基力场构建
专题二:高分子聚合物的TOP文件构建
专题三:粗粒化模型建立

“第一性原理计算方法及应用” 2019年11月7日——11月11日  北京
一、VASP基本原理及计算准备(基础篇)        
课程1 VASP原理及Linux入门基本介绍
课程2 Linux常用命令与VASP输入出输出文件介绍
课程3 VASP编译安装及结构建模介绍
二、VASP相关参数置技巧及参数收敛性测试(升阶篇)        课程4 VASP输入参数设置技巧
课程5 VASP结构优化
课程6 VASP收敛性测试
二、电子结构、弹性模量、声子谱、分子动力学(实战篇:材料计算专题)
课程7 VASP材料理化性质计算及结果分析  
三、吸附、过渡态以及电荷分析(实战篇:催化反应专题)
课程8 VASP表面催化反应计算及结果分析
四、实例解析(一)(提升篇:特定体系计算)        
课程9 复习实例巩固一:体弹性常数及特定体系计算
五、实例解析(二)(提升篇:表面与界面体系计算)        
课程10 复习巩固二:表面与界面
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