极客学术 - 科研知识第一站

招聘版主，希望大神积极参加！

极客学术

2018-12-17

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为了更好促进求职招聘版的发展，招聘各版版主，有意者请积极参加，随时联系我。基本要求： 1.及时回复版内新人咨询，有相对丰富的求职经验（kanke），热心助人； 2.删除广告贴、重复贴，置顶推荐好的求职经验分享帖 ...查看全文

5229 1 0 0 版主招聘，申请及离职

发帖奖励标准

极客学术

2018-12-19

置顶

帖子评分奖励和惩罚标准该标准适用于论坛各个版块（各区的区务版块不包括在内），个别区由于特殊原因会有所不同，在贴后会有说明。该标准只规定了奖罚的上下限，希望各位版主公平公正的评分。奖励标准中所提及的精 ...查看全文

4677 0 0 0 版主招聘，申请及离职

极客学术积分规则

极客学术

2018-12-18

置顶

论坛总积分计算方程式：发帖数 * 0.5 + 威望 + 贡献 + 精华帖数 + 在线时间(小时) *.03 + 好友数 1.每天登录将获得2点极客币和5积分的增长。 2.参与论坛投票获得极客币1点同时总积分加1（此项每天只能获得10点） ...查看全文

4507 0 0 0 版主招聘，申请及离职

CADD药物设计,MD

子牛

2022-3-11

新窗

线上直播，全程无限次回放观看关于举办CADD药物设计+薛定谔专题+分子动力学模拟GROMACS--AMBER的课程通知课程一：CADD药物分子相互作用、分子对接、靶点预测专题 1.1CADD药物分子相互作用、分子对接、靶点预测专题 ...查看全文

440 0 0 0 分子模拟 [GROMACS]

“LAMMPS分子动力学技术与应用”线上实战

hdp-ky

2020-12-18

图片新窗

关于举办“LAMMPS分子动力学技术与应用”线上实战培训的通知各有关单位:分子动力学模拟是一种研究分子体系结构与性质的重要方法，已被广泛用于化学化工、生物医药、材料科学与工程、物理等学科领域。传统实验需要大 ...查看全文

2816 0 0 0 分子模拟 [LAMMPS/DL_POLY]

计算机辅助药物设计以及Gromacs分子动力学

疯不觉

2020-12-16

精图片 - [回帖奖励 1 ] 新窗

当今，随着人类基因组计划的完成、蛋白组学的迅猛发展，以及大量与人类疾病相关基因的发现，药物作用的靶标分子急剧增加；计算机辅助药物设计是通过计算机模拟、计算和预算药物与受体生物大分子之间的关系，设计和优 ...查看全文

7697 0 0 0 分子模拟 [GROMACS]

gromacs分子动力学及计算机辅助药物设计培训

白茶清欢

2020-7-29

新窗

当今，随着人类基因组计划的完成、蛋白组学的迅猛发展，以及大量与人类疾病相关基因的发现，药物作用的靶标分子急剧增加；计算机辅助药物设计是通过计算机模拟、计算和预算药物与受体生物大分子之间的关系，设计和 ...查看全文

2369 1 0 0 分子模拟 [GROMACS]

MS分子动力学模拟后查看RDF曲线峰杂乱的问题

没放糖的咖啡

2020-5-13

图片新窗

做了单个分子吸附在金属表面上的动力学，在查看分子内具体原子距离金属表面的距离，用forcite RDF，选定该原子为set a, 金属表面第一层所有原子为set b，出来的径向分布函数曲线很乱，没有明显峰值点，如图，请问是 ...查看全文

2263 6 0 0 分子模拟 [热点前沿问题讨论]

分子动力学及第一性原理看看

旧梦如烟

2019-10-31

新窗

分子动力学模拟、第一性原理计算被广泛用于生命科学、化学工程、物理、医药、材料科学、电子学等领域。由于传统实验需要大量的人力物力而且耗时，而计算机模拟的方法省时省力，能有效提高科研效率；分子动力学模拟、 ...查看全文

2454 0 0 0 分子模拟 [资源]

lammps培训 vasp培训 gaussian培训 gromacs培训

kh668

2019-10-31

新窗

2597 0 0 0 分子模拟 [资源]

分子动力学与第一性原理

hdp-ky

2019-9-18

新窗

分子动力学及第一性原理 https://share.weiyun.com/56VAbyF 三个课程，每班每人￥4300元（含报名费、培训费、资料费），食宿费用自理。 9月30日之前汇款优惠400，10月12日之前汇款优惠200，名额有限；如需开具会议 ...查看全文

2726 0 0 0 分子模拟 [资源]

lammps基础到进阶

旧梦如烟

2019-8-2

新窗

互动派（北京）教育科技有限公司举办的lammps与vasp培训 1、小班授课，培训教室配备有服务器、投影； 2、对知识进行系统讲解，由浅入深，配合案例解析边讲边练，让学员能运用模拟软件针对每个技术点进行上机操作 ...查看全文

2771 1 0 0 分子模拟 [LAMMPS/DL_POLY]

拟合液滴的边界

蕥沫

2018-12-6

新窗

我通过lammps模拟一个液滴，请问怎么能把它的边界拟合成一个圆？十分感谢

2389 1 0 0 分子模拟

lammps反应力场

hustlin

2018-12-29

新窗

lammps采用reaxcc力场时，怎么采用混合力场，采用混合力场时，能实现shake的功能吗？

2424 0 0 0 分子模拟 [LAMMPS/DL_POLY]

关于lammps的学术交流，大家都来谈谈自己研究的方向以及...

俏皮小妞

2018-12-6

新窗

各位师兄师姐，大家好，一起来谈论下自己用lammps计算的方向以及进展，说出自己遇到的问题，一起跟帖讨论啊!查看全文

2364 3 0 0 分子模拟

cvd金刚石涂层分子动力学模型构建

雪鸾莎

2018-12-6

新窗

请问各位小伙伴： lammps或者molecular dynamic 能建立分别建立微米金刚石涂层和纳米金刚石涂层吗？如果可以的话，建立这两种不同的模型应该从哪些方面进行区分呢？谢谢大家！！！ ...查看全文

2159 0 0 0 分子模拟

lammps二元内部建模

香雪醉清风

2018-12-6

新窗

各位谁对二元内部建模有研究吗

2058 0 0 0 分子模拟

lammps软件的data文件撰写（涉及到compass力场）

轻舞倾城

2018-12-6

新窗

lammps里面怎么把impropers角度导入到data文件里面？有人用过lammps里面的compass力场吗？怎么得到相应的impropers参数呢？查看全文

2156 0 0 0 分子模拟

三斜晶体剪切的应力应变表示

佐小安

2018-12-6

新窗

lammps三斜晶体剪切，fix def all deform 1 xy erate 0.01 units box remap v，想问下剪切应力，剪切应变怎么表示？查看全文

2225 0 0 0 分子模拟

如何输出 compute gyration/chunk 计算回转半径结果

醉冷倾城

2018-12-6

新窗

求助，讲lammps官网上的计算回转半径语句： compute cc1 all chunk/atom molecule compute myChunk all gyration/chunk cc1 fix 1 all ave/time 100 1 100 c_myChunk file tmp.out mode vector 改为 compute cc1 ...查看全文

2196 2 0 0 分子模拟

lammps)关于tio2的in文件和data文件

韩莫莫

2018-12-6

新窗

(lammps)关于tio2的in文件和data文件例子，不知道data文件怎么写 MS对其倒入立场的时候 MS内无适合tio2的立场啊求大神指导查看全文

2047 0 0 0 分子模拟

lammps新手水合物分子动力学模拟

黑白格子控

2018-12-6

新窗

我用lammps来模拟PETG的拉伸试验，无论这个程序跑多久，erate值是多少，链始终拉不断。即使在ovito中观察到链已经被拉到足够长，他还是不断。所以我的问题就是怎么才能把它拉断。下面是我的源文件： variable projec ...查看全文

2203 3 0 0 分子模拟

Lammps建模怎么设置电荷

苏小夕

2018-12-6

新窗

请问我用的Pair_style buck/coul/long 建模是直接在in文件里完成的，模型比较简单。运行错误显示为system with no charge. 这个该怎么给模型输入电荷呢？查看全文

2133 0 0 0 分子模拟

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