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发表于 2019-1-3 10:09:54
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PyMOL着实不是一个好的分子模拟软件,它更适合用于分子图形显示。
多肽有多少个氨基酸?如果较少,用Amber的tleap或者其他软件构建好初步模型,然后进行分子动力学(MD)模拟即可;如果很多,采用Modeller等软件进行同源模建,再进行MD模拟。Amber和Modeller教程参见:"http://www.yinfotech.cn/blog/tutorial/" |
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