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楼主 |
发表于 2018-12-12 16:58:46
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只看该作者
自己提问自己解答:
具体用到Find Patterns dialog。先从长链中copy出4个C相连的结构,放在一个新的文件3D Atomistic文件中,或者手动画4个C相连的结构,保存,命名为dihedral.xsd。用工具箱中measure torsion来测定这4个C的dihedral angle的值,此时dihedral.xsd中出现torsion的值。保存dihedral.xsd,并选中这个dihedral的值,注意不要选择上原子。
调换到要测量dihedral angle的文件或者轨迹文件,用edit-->find pattens。在pattern document里选择dihedral.xsd,在match property里选择elementType,点击Find。然后所有含4个C的二面角的值都计算出来了,这需要时间。
用forcite-->analysis,此时按预设值, 点analyze即可,不用选择sets项,然后就会出来dihedral angle的分布图 |
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