有文献显示，某一蛋白的肽链段中的氨基酸会发生改变，造成蛋白变化。能否手动修改PDB文件将氨基酸残基改变，营造突变位点。想问问大家，如何直接修改PDB文件？如果是直接修改PDB文件会不会改变蛋白二级三级结构？如果是改变半胱氨酸，它的二硫键怎么处理？修改后对对接过程有什么影响？谢谢。

我也在做相应的问题，可以一起讨论一下

迷茫中....现在在学习DS和SYBYL，目前还没解决...求助大神啊~