各位老师，我最近在做autodockvina运行时，输入命令 vina -config conf.txt -log log.txt 时发现不能识别ligand.pdbqt文件里的硼原子，我不知道在vina运行中怎么解决，之前查了帖子，都是添加原子参数在AD4_parameters.dat里，然后加上题头parameter_file AD4_parameters.dat 在dpf 文件里，可是运行vina时不需要dpf文件啊  郁闷无解中。希望各位解惑一下，谢谢各位老师啦。

http://autodock.scripps.edu/faqs ... not-recognized-201d  哈哈 在网上找到答案了 也给后来的朋友们看一下