在蛋白质与抑制剂对接时，从文献中得知结合部位的大致位置（某几个氨基酸附近），在对接时用最大簇，对接后的位置与文献中的位置不一样，是不是要换其他簇？
还有就是之前可以用RMSD来衡量对接部位的好坏，这里没有原配体作参照，就不能用RMSD，那是否可以用其他的参数来衡量对接的好坏？

咋个没人