新手上路

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沙发

楼主 |
发表于 2018-11-28 14:03:21
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只看该作者
在/root/Amber/amber11/src/mmpbsa_py找到了MMPBSA,但是执行时出错:
node1:~/Amber/amber11/gujiali # /root/Amber/amber11/src/mmpbsa_py/MMPBSA.py -O -i mmpbsa_1b.in -o final_mmpbsa.dat -sp com_wat.top -cp com.top -rp pro.top -lp lig.top -y prod1.mdcrd
ptraj found! Using /root/Amber/amber11/AmberTools/exe/ptraj
Error: sander is needed for MMPBSA
NOTE: All files have been retained for debugging purposes. Type MMPBSA.py --clean to erase these files.
本人安装的是并行版sander,在exe文件夹中只有sander.MPI,不知道是不是和这个有关?
请高手指教啊 |
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