提问
搜索

position restraints

来源：分子模拟  › 倒序浏览
  • 回答数

    2

  • 浏览数

    1859

  • 收藏数

    0

我来回答 发表话题
作者：碎了的花 发表于 2018-11-26 16:51:02
跳转到指定楼层
想在Gromacs做MD的时候，限制分子的运动。我的分子是个寡聚物，想限制两端的两个原子，如何具体操作？请写详细点儿，谢谢哈！

分享：
举报
回复

使用道具

一季花落

该用户从未签到

新手上路

Rank: 1

积分
41
极客币
56
主题
9
帖子
27
注册时间
2018-11-5
在线时间
2 小时
性别
保密
发表于 2018-11-26 16:51:11 | 显示全部楼层
具体操作如下
genrestr 产生一个 posres.itp约束文件（只有两个原子的）
在mdp文件里define=-POSRES
回复

使用道具 举报

碎了的花

该用户从未签到

新手上路

Rank: 1

积分
39
极客币
59
主题
10
帖子
29
注册时间
2018-11-5
在线时间
2 小时
性别
保密
 楼主| 发表于 2018-11-26 16:51:25 | 显示全部楼层
回复

使用道具 举报

高级模式 评论
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册 微信登录
B Color Image Link Quote Code Smilies
关于作者
碎了的花

用户组：新手上路

  • 主题

    10

  • 帖子

    29

  • 关注者

    1

关注 发私信
楼主新帖
Archiver|手机版|小黑屋|极客学术 |京ICP备16066145号-3
Powered by Discuz! X3.4  © 2014-2020 Comsenz Inc.