求助各位大神：Gromacs中如何在一次模拟运行中获取每一步的原子坐标？

nstxtcout=1

你好！谢谢回复，我是指输出，而不是记录进traj文件。或者说如何用traj文件输出运行过程中记录的每一步的信息？

xtc 或者trr 文件中就记录的有啊
你可以导入到VMD中看啊，也可以直接输出来

trjconv -s .tpr -f .xtc -o conf.gro -sep
You will get a series coordinate file. It should work.

非常感谢！