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作者:暗恋的杯具 发表于 2018-11-26 16:08:00
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大家好,我现在在算一个蛋白质,用gromacs做MD,这个蛋白中包含了2FE-2S,这个2FE-2S中的Fe原子和cys配位,为了得到它的参数,我采用gaussian09计算,简化了模型,用SCH3来取代cys残基,这里我有一点不太确定的是,这样计算得到的Fe和S的电荷参数需要做其他的处理吗?还是直接用 ?
希望 大家指点一下
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