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作者:谜一般的女人 发表于 2018-11-26 14:52:53
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rt,我要模拟的体系里有ADP存在,所以我想引入别人已经做好的关于ADP的力场文件。不过这些都是基于amber力场,不知道在gromacs中该如何导入。
求各位大侠指导,先谢谢了
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发表于 2018-11-26 14:53:43 | 显示全部楼层
个人观点是:gromacs里面有amber力场,你把ADP里的力场参数添加进去不就可以用了吗?
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 楼主| 发表于 2018-11-26 14:54:16 | 显示全部楼层
拿ADP这个分子来说,它有amber力场中没有的原子类型,
在用amber导入时需要在leaprc文件中加入这些原子类型,
我对gromacs不熟悉,不知道这个在gromacs中该如何处理。
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