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作者:饶雪漫 发表于 2018-11-26 11:22:49
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手里有一个lipid双层膜,发现system size跟box vectors不一样。
system size 是计算的x,y,z的最大最小差值,但box vectors是直接输出的gro文件的最后一行。
如果把box vectors改成system size,会发现外面有一层基本是空的,只有一个分子伸到了边。
看来还是不能改box vectors的值,那么就会出现box之外有粒子的问题,这是怎么回事?
谁能帮忙回答一下?

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