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作者:ashley 发表于 2018-11-23 11:33:47
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请问一下,有人遇到过使用gromacs的x2top命令时候,对于n2t文件中定义的原子不能正确识别的情况么?
如-OH和-COOH中的H原子。n2t中定义:
H H1 0.45 1.008 1 O 0.0960 ;-COOH
H H2 0.418 1.008 1 O 0.12 ;-OH
x2top之后全部识别为H1,即使故意加大-OH中OH键长,也是识别不出H2。
谢谢啦!
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