• 回答数

    3

  • 浏览数

    1874

  • 收藏数

    0

作者:没网名用了 发表于 2018-11-23 10:53:18
跳转到指定楼层
大家好! 在GROMACS 中添加离子,如Nacl,可以用-pname NA -nname cl 表示
不知道醋酸钠应该如何表示?
谢谢啊!

分享:
回复

使用道具

该用户从未签到

新手上路

Rank: 1

积分
17
极客币
49
主题
9
帖子
24
注册时间
2018-11-5
在线时间
2 小时
性别
保密
 楼主| 发表于 2018-11-23 10:53:35 | 显示全部楼层
问题解决啦!与大家分享一下
先用PRODRG构建乙酸CH3C00H的gro文件;
然后用genbox -ci -nmol 添加乙酸;
再用genion-pname添加 Na离子
回复

使用道具 举报

该用户从未签到

新手上路

Rank: 1

积分
19
极客币
52
主题
8
帖子
28
注册时间
2018-11-5
在线时间
1 小时
性别
保密
发表于 2018-11-23 10:53:42 | 显示全部楼层
感谢分享。大牛总会自问自答。哈哈
回复

使用道具 举报

该用户从未签到

新手上路

Rank: 1

积分
17
极客币
49
主题
9
帖子
24
注册时间
2018-11-5
在线时间
2 小时
性别
保密
 楼主| 发表于 2018-11-23 10:53:53 | 显示全部楼层
回复

使用道具 举报

高级模式 评论
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册 微信登录