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作者:怀念你的爱 发表于 2018-11-23 10:36:24
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我做的模拟中有2种物质,分别的立场参数都找到了,但是却不是同一种力场,将其中一种改为另一种又觉得难度太大了,不懂哪位高手知道gromacs能混用两种力场吗?怎么个混用法?急啊!
谢谢大家先!
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发表于 2018-11-23 10:36:33 | 显示全部楼层
每个力场都有自己独立的参数,是根据牛顿力学方程,在施加力场下,记录速度,坐标就得到轨迹,如果两种力场的话,建立的是两个体系。如果同一力场的话,觉得模拟体系会更合理些
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发表于 2018-11-23 10:36:41 | 显示全部楼层
完全可以两种不同势能加进去,但是他们之间的作用要确定好,这是gromacs的优势之一
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 楼主| 发表于 2018-11-23 10:36:49 | 显示全部楼层
如何弄?可否具体点?我这里是混用2个力场,其实是想只用一个力场的,不过力场改起来也不是那么容易的。
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发表于 2018-11-23 10:36:54 | 显示全部楼层
如果你的体系中力场参数,你可以做TABLE
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 楼主| 发表于 2018-11-23 10:37:07 | 显示全部楼层
谢谢   
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发表于 2018-11-23 10:37:15 | 显示全部楼层
分别查出体系中所有粒子间的作用力场参数,然后做TALE
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 楼主| 发表于 2018-11-23 10:37:41 | 显示全部楼层
情人总分分合合 发表于 2018-11-23 10:37
分别查出体系中所有粒子间的作用力场参数,然后做TALE

谢谢     
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