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作者:自欺欺人 发表于 2018-11-23 10:33:54
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Warning: 1-4 interaction between 1791 and 1794 at distance 1.010 which is larger than the 1-4 table size 1.000 nm
These are ignored for the rest of the simulation
This usually means your system is exploding,
if not, you should increase table-extension in your mdp file
请问这个错误该怎么改啊, table-extension又是什么意思,要把这个参数加到mdp文件吗?在mdout.mdp中默认的table-extension是1,我要改成多少呢??
另外,如果说是结构的原因,那么原子重叠,键太长这种怎么看出来的,请指点一下,谢谢了

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发表于 2018-11-23 10:34:04 | 显示全部楼层

1.000 nm 你见过哪个成键原子对之间有10个A的 你应该开可视化软件看看
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发表于 2018-11-23 10:34:21 | 显示全部楼层
你的这个1-4作用距离太大,一般的话只有0.9nm到1nm,而你的却是1.01nm了,需要修改一下。
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 楼主| 发表于 2018-11-23 10:34:28 | 显示全部楼层
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