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作者:百花残 发表于 2018-11-22 14:41:49
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vasp也是分子动力学常用的软件之一,但这里相关的资料太少,这是我从小木虫上转载的,希望对大家有帮助。
http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=1744011
vasp做分子动力学的好处,由于vasp是近些年开发的比较成熟的软件,在做电子scf速度方面有较好的优势。
缺点:可选系综太少。
尽管如此,对于大多数有关分子动力学的任务还是可以胜任的。
主要使用的系综是 NVT 和 NVE。
下面我将对主要参数进行介绍!
一般做分子动力学的时候都需要较多原子,一般都超过100个。
当原子数多的时候,k点实际就需要较少了。有的时候用一个k点就行,不过这都需要严格的测试。通常超过200个原子的时候,用一个k点,即Gamma点就可以了。
INCAR:
EDIFF一般来说,用1E-4 或者1E-5都可以,这个参数只是对第一个离子步的自洽影响大一些,对于长时间的分子动力学的模拟,精度小一点也无所谓,但不能太小。
IBRION=0 分子动力学模拟
IALGO=48 一般用48,对于原子数较多,这个优化方式较好。
NSW=1000多少个时间步长。
POTIM=3时间步长,单位fs, 通常1到3.
ISIF=2计算外界的压力.
NBLOCK= 1多少个时间步长,写一次CONTCAR,CHG和CHGCAR,PCDAT.
KBLOCK=50 NBLOCK*KBLOCK 个步长写一次 XDATCAR.
ISMEAR=-1费米迪拉克分布.
SIGMA =0.05 单位:电子伏
NELMIN=8一般用6到8, 最小的电子scf数.太少的话,收敛的不好.
LREAL=A
APACO=10 径向分布函数距离, 单位是埃.
NPACO=200径向分布函数插的点数.
LCHARG=F 尽量不写电荷密度,否则CHG文件太大.
TEBEG=300初始温度.
TEEND=300 终态温度。 不设的话,等于TEBEG.
SMASS-3NVE ensemble;-1 用来做模拟退火。大于0 NVT 系综。
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发表于 2018-11-22 14:42:04 | 显示全部楼层

正在学习vaps作MD,不错的信息
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发表于 2018-11-22 14:42:18 | 显示全部楼层
ISIF=2 主要是fix volume, fix cell shape,只允许原子位置移动吧。
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 楼主| 发表于 2018-11-22 14:42:33 | 显示全部楼层
是的,只允许原子位置移动。
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发表于 2018-11-22 14:42:48 | 显示全部楼层
可能是我做的体系过大吧。有几个问题,想向你请教。
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 楼主| 发表于 2018-11-22 14:42:53 | 显示全部楼层
我一直在用,并没有你所说的情况。
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发表于 2018-11-22 14:42:55 | 显示全部楼层
将要做分子动力学,一窍不通ing
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 楼主| 发表于 2018-11-22 14:43:09 | 显示全部楼层
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