请问，用sybyl对接后，用pymol导入蛋白和配体时，导入优化后的蛋白还是PDB网站下载的蛋白，进行画图？谢谢！我对接的 是1ysw蛋白，不知为什么pymol打不开优化后的蛋白，显示bad substructure id，请大神们帮助！

对接后当然用处于对接状态的复合物来作图了。