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新窗
autogrid时盒子大小如何确定
自欺欺人
2018-12-5
新窗
各位,求问autogrid的坐标和盒子大小根据哪些因素来确定啊,新手不懂啊。。。。
1804
3
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分子对接
请问ligand处理时无法检测root,choose torsions报错
失之永失
2018-12-5
新窗
1961
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分子对接
autodock vina柔性对接后结果怎么合并
迩若不离
2018-12-5
新窗
autodock vina柔性对接后结果输出后,里面是小分子配体贺蛋白的柔性残基,怎么合并到完整的蛋白里去啊
查看全文
1983
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分子对接
Gold中如何指定水分子的初始位置?
爱我者我必爱
2018-12-5
新窗
我想预测关键水分子在口袋处的结合的位置,有了水分子的初始坐标,但怎么样指定这个坐标呢?
查看全文
1818
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分子对接
AUTODOCK如何保存两个及以上的分子为pdb
依赖太阳生存
2018-12-5
新窗
怎么用AUTODOCK保存两个及以上的分子为pdb文件。我打开配体和受体文件直接保存PDB文件提示 多余两个分子不能保存。
查看全文
1890
3
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分子对接
Auto-dock求助大神
不分手的恋爱
2018-12-5
新窗
Auto-dock中,有这步:新建工作文件夹“1HSG”,将编译好的“autogrid4,autodock4”程序 不知道是什么意思,求助大神啊
查看全文
2013
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分子对接
LeDock在Centos6.2下的安装问题
让你忘记我
2018-12-5
新窗
老师,您好!我想用ledock进行虚拟高通量筛选,从网上下载的ledock运行时也碰到论坛里面的问题:ledock: /lib64/libc.so.6: version `GLIBC_2.14' not found (required by ledock)。但由于服务器使用的人很多,管理 ...
查看全文
1958
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分子对接
Autodock能做DNA和蛋白的对接吗?
对对碰
2018-12-5
新窗
我想预测转录因子和靶基因之间的相互作用关系,可以用autodock来进行分子对接吗?
2120
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分子对接
询问vina的安装问题,请赐教,谢谢!!
倚楼醉听曲
2018-12-5
新窗
如题,我的vina安装路径为:C:\Program Files\The Scripps Research Institute\Vina 可是为啥Vina.exe就是打不开呢,然后又看到网上说设置环境变量,我也照着设置了,可是还是打不开,是不是环境变量设置错误了,还 ...
查看全文
2018
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分子对接
新手求大神指导两个问题
问君何时娶
2018-12-5
新窗
1、Grid →Grid Box… 打开Grid Options对话框,将格子的大小设置为X, Y, Z: 40, 40, 40,我看了两个教程,这个格子大小的设置都不一样,也没说为什么设这么大,这是什么意思? 2、然后将格子中心设为-7.320, ...
查看全文
2098
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分子对接
sphgen 怎么下载啊
纠缠纠葛
2018-12-5
新窗
请问一下,我看了2012 DOCK tutorial with Streptavidin 的教程。里面有一个sphgen 的软件,但是我在网上搜索了半天也没找到下载的地方,每一个都是提一下需要用这个软件。能告诉一下到底是一个什么软件么,在哪儿能 ...
查看全文
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分子对接
autodock对接处理
笑多了会怀孕
2018-12-4
新窗
新人求赐教:请问autodock对接时会删水加氢,原因是什么呢??不删水的话可以么,对结果有影响么?
查看全文
2331
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分子对接
有人遇到过warning:found an h-bonding atom with three bonded atoms...?
莂說対罘
2018-12-4
新窗
运行autogrid4遇到 warning:found an h-bonding atom with three bonded atoms,atom serial number 718,但是程序还是能往下跑...会对结果有影响么?怎么解决啊?
查看全文
2032
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分子对接
Autodock对接作用力分析?
执念一人
2018-12-4
新窗
文章中用到Autodock小分子与蛋白作用模式图,审稿人提问:How do the authors know that ligands bound to these enzymes by hydrophobic effect and van der waals forces? 请问autodock中哪些参数,或者什么图模式 ...
查看全文
1960
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分子对接
ADT4中扪autogrid出现如下错误,什么原因,如何解决,求高...
假面绅士
2018-12-4
新窗
ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "E:\Mgltools\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **k ...
查看全文
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分子对接
autodock vina
灭零
2018-12-4
新窗
哪位大神知道vina对接时的温度,这个对接温度可以调吗?
1900
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分子对接
请问dock适用于怎样的分子对接,能否用于dna与蛋白质的对...
狩猎少女
2018-12-4
新窗
就是想知道dock和autodock和DS他们之间的区别, 都适用于怎样的分子对接,能否用于dna与蛋白质的对接。 还用能用于dna与蛋白质对接的软件。急急急,求大家帮帮忙 ...
查看全文
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分子对接
Lodock结果如何分析
怒默语晨
2018-12-4
新窗
因为初次使用LeDock,感觉教程写的很好,唯一遗憾是得到的结果不知道怎么操作. 请问对接后生成的结果能不能看到配体和受体的作用位点,能否看到氢键,能否得到和Autodock类似的图呢?如果能,具体怎么操作,能不能普 ...
查看全文
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分子对接
核酸与小分子之间的对接
你画我猜
2018-12-4
新窗
各位大神,求指教,谁知道什么软件可以做核酸与小分子之间的对接吗????谢谢各位了
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分子对接
AUTODOCK软件下载
突击风暴
2018-12-4
新窗
求分子对接AUTODOCK软件包!!!
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