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我没有做过点缺陷的统计。
但听老师讲过,LAMMPS没有直接统计缺陷的命令,需要把数据导出来,自己写程序统计。一个可行的思路是用LAMMPS输出每个原子的配位数,用配位数来判断缺陷;比如fcc单晶Cu的正常配位数是12,那么一个空位缺陷周围原子的配位数应该是11,一个间隙原子缺陷的周围原子的配位数应该是13。缺陷少的话,用VMD或者ovito直接数就行,多的话就只能写小程序来统计了。
你说的文献上是另一种思路吧,选定一个原子或者晶格位置,计算它附近的一个球体空间内的其他原子个数,其实原理和计算配位数差不多。
缺陷统计是MD损伤模拟中非常基本的功夫,技术很成熟,写程序应该不难。我也做晶体缺陷,现在还在弄zbl势能文件,没到统计缺陷的地步。
祝你成功。 |
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