我想计算一个分子的熵，VDW，elec等曲线，请问用amber可以计算单个蛋白的熵？VDW？吗？希望高手能给我少许的指点,先说声谢谢了！

单个蛋白的熵？没太理解，是否指某个氨基酸的熵。建议考虑已经退役的amber模块ANAL, 它只能计算potential
energy，但是好处是可以给蛋白质残基分组。其实是一个挺好的想法呢。