Pymol处理对接结果
1.pymol如何改变氨基酸残基的Label的颜色，大小和位置2.Pymol如何改变氢键的颜色，粗细
3.pymol如何改变distance的大小，位置和颜色
1. （1）Label的大小，颜色和位置可以通过以下命令设置：
set label_size, 14 #14，换成自己想设置的是大小
set label_color, red #red,换成自己想设置的颜色
set label_position, (3,2,1) #(3,2,1)相对于原坐标在x，y，z轴上的偏移量
（2）Label的位置可以手动设置
点击pymol窗口右下角的Mouse Mode，将3-Button Viewing模式更改成3-Button Editing模式
按住ctrl，鼠标左键拖动Label，可以移动
按住ctrl和shift，鼠标左键拖动Label，可以在z轴上移动
label的详细设置，见https://pymolwiki.org/index.php/Label
2和3每有搞懂需求。
2中的氢键是用什么表示的呢？虚线（dash，自动找的）或者棍（stick，ligplot+导到pymol的），或者其他。
如果是虚线（dash），可以通过以下命令设置颜色，粗细
set dash_color, red #red，换成你需要的颜色
set dash_radius. 0.25 #0.25, 换成你需要的粗细（宽度）
如果是棍（stick），也类似
set stick_color, red
set stick_radius, 0.25
3中的distance是根据坐标计算出来的，大小是不能改的，如果只是小数位数不同造成的四舍五入，可以用下面的命令更改
set label_distance_digits, 3#3, 表示小数点后的位数
distance的数字就是一个Label，颜色、尺寸等都可以使用设置Label的方式更改 请问为什么在我Discovery Studio3.0中同源建模得到的目的蛋白在Pymol中打开后不能显示二级结构，模板蛋白在Pymol中打开后就可以显示二级结构，谢谢！ :handshake
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