MS分子动力学模拟后查看RDF曲线峰杂乱的问题

做了单个分子吸附在金属表面上的动力学，在查看分子内具体原子距离金属表面的距离，用forcite RDF，选定该原子为set a, 金属表面第一层所有原子为set b，出来的径向分布函数曲线很乱，没有明显峰值点，如图，请问是怎么回事？如何解决，谢谢！

我用的是std文件，一共有250frame, 选择的是统稳定后的40frame

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显示全部楼层 · 发表于 2020-5-13 15:33:29

洒脱的像风发表于 2020-5-13 15:32
你好，我想请教下如何选择平衡后的40呢？

Std做出来就是这样的，用xsd做出来就平滑很多

显示全部楼层 · 发表于 2020-5-13 15:32:54

你好，我想请教下如何选择平衡后的40呢？

显示全部楼层 · 发表于 2020-5-13 15:32:08

晚风撩人发表于 2020-5-13 15:31
试过了

这个对结果没有影响的

显示全部楼层 · 发表于 2020-5-13 15:31:11

晚风撩人发表于 2020-5-13 15:30
怎么样

试过了

显示全部楼层 · 发表于 2020-5-13 15:30:29

晚风撩人发表于 2020-5-13 15:29
互换下ab设置对象

怎么样

显示全部楼层 · 发表于 2020-5-13 15:29:45

互换下ab设置对象