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作者:封神 发表于 2018-12-5 17:11:00
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想在AUTODOCK 进行蛋白与小分子对接,但是在pymol分离小分子的时候发现pdb中的小分子是两个一样的小分子但是叠加在一起的,请问怎么只取出来一个呢?

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发表于 2018-12-5 17:11:15 | 显示全部楼层
请问PDB ID是多少,我可以帮你看看。
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发表于 2018-12-5 17:11:26 | 显示全部楼层
(1)直接文本文件打开pdb文件,删掉一个;(2)用其他软件打开,例如ds,可以删掉
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 楼主| 发表于 2018-12-5 17:11:35 | 显示全部楼层
谢谢         
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发表于 2018-12-5 17:50:01 | 显示全部楼层
有没有raccon的下载地址呢
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发表于 2018-12-5 17:50:31 | 显示全部楼层
谢谢分享!我也是刚开始学习,感觉受体文件很难准备,老是报错,好像是说某些氨基酸残基没加氢,不知是什么原因。不知楼主有没有碰到这种情况。希望以后能多交流
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