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蛋白SER残基特殊处理

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作者：望誰回眸 发表于 2018-11-28 14:44:32
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大家好，我模拟的protein-lig体系中，蛋白的SER165残基需要将羟基上的氢原子去掉，但是amber默认的SER的羟基是完整的。
请问有什么办法能生成SER羟基氢原子不存在的蛋白crd文件和top文件的办法吗？

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发表于 2018-11-28 14:44:41 | 显示全部楼层
只能做一个小分子文件了吧 用antechamber来做
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 楼主| 发表于 2018-11-28 14:44:57 | 显示全部楼层
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