大家好，我是最近刚接触Amber。
想对蛋白质分子做一些MD模拟计算，基本操作会一些。
现在想把某两个氨基酸之间的距离固定起来做计算。不知道有没有可能。
如果有可能的话是要在mdin文件里写入什么参数？
一些实例中，
ntr = 1,
restraint_wt = 10.0,
restraintmask = ' :1-151'
这样就可以固定1-151残基坐标。
但是我只想让115-118和190-193之间距离不变（能否给定距离值？），坐标可以变化，又该如何做呢？

大家好，我是最近刚接触Amber。
想对蛋白质分子做一些MD模拟计算，基本操作会一些。
现在想把某两个氨基酸之间的距离固定起来做计算。不知道有没有可能。
如果有可能的话是要在mdin文件里写入什么参数？
一些实例中，
ntr = 1,
restraint_wt = 10.0,
restraintmask = ' :1-151'
这样就可以固定1-151残基坐标。
但是我只想让115-118和190-193之间距离不变（能否给定距离值？），坐标可以变化，又该如何做呢？