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作者:云游四海 发表于 2018-11-26 17:44:36
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我先从 ftp://ftp.cmbi.ru.nl/pub/software/dssp/下载了linux 版本的dssp
解压缩到目录/home/jiaobao/ruanjian/dssp/
之后重新命名为dssp
然后使用 export DSSP=/home/jiaobao/ruanjian/dssp/dssp
这一步根据http://www.gromacs.org/Documentation/Gromacs_Utilities/do_dssp
可是我在使用的时候,出现错误:
Fatal error:
DSSP executable (/usr/local/bin/dssp) does not exist (use setenv DSSP)
For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS
website at http://www.gromacs.org/Documentation/Errors
-------------------------------------------------------
纠结了很久还是没有搞定,哪位前辈用过这个?
请多指教!
非常感谢!
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发表于 2018-11-26 17:44:53 | 显示全部楼层
你看一下dssp可执行文件在哪一个目录,很可能你把环境变量设置错了。
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发表于 2018-11-26 17:45:01 | 显示全部楼层
export is not work to your system
you just need to use 'setenv DSSP /home/jiaobao/ruanjian/dssp/dssp'
try it XD
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 楼主| 发表于 2018-11-26 17:45:10 | 显示全部楼层
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