本帖最后由 团子良 于 2022-12-29 16:28 编辑
用途采用ORCA 4.2程序进行量子化学计算。已实现的作业类型包括:单点能、几何优化、振动频率、ECD/UV、NMR、红外(IR)和拉曼光谱(Raman)计算。 入口功能入口:平台左侧菜单栏【计算方案】->【大方案】->【量化计算】->【量化计算(ORCA 4.2)】 步骤1. 上传分子结构文件上传具有良好3D结构的分子文件,支持mol、mol2、pdb、sdf和sd格式。
2. 设置净电荷、自旋多重度和选择溶剂模型
此三项为统一设置,对所有分子生效。因此,上传的分子结构须电荷、自旋多重度相同,不同性质的分子结构应分别建立任务进行计算。 3. 设置计算步骤 添加计算步骤,选择 作业类型、 理论水平和 溶剂。各作业类型的含义是: Optimization:几何优化 Frequency:振动频率分析 ECD/UV:ECD/UV计算 NMR:NMR计算 IR:红外计算 Raman:拉曼光谱计算
4. 添加高级配置 个别 作业类型还需额外设置。点击 高级配置栏中的【添加】,在弹出的对话框中按提示设置。 例如,ECD/UV计算需要选择激发态数目,默认为30个。激发态数目越多,ECD/UV图谱覆盖的波长范围越广(从长波长到短波长),同时,计算量(时间)也越大。
又如,Rman计算需要指定入射波长,如532 nm。若需其他波长,可选择或填写。 5. 点击【提交】,选择支付方式,点击【确认】,提交任务。注意:本方案为后付费模式,按每个分子的实际计算时间进行扣费,请确保账户余额足够。 1、若不清楚总费用是否足够,可先计算一个构象分子,通过【用户中心】-【费用账单】查看其实际费用,然后确定需要计算的构象分子数目和估计总费用。 2、当可用余额< 100元时会发出预警通知,发生欠费时会发出欠费通知,严重欠费时会立即终止任务。默认为短信通知,可在平台左侧菜单栏【设置】->【消息提醒】->【计算】处设置其他通知方式。 6. 在 文件列表可下载所有计算文件。
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