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蛋白大分子在加工过程中结构变化模拟
心尖上的刺青
2019-1-3
新窗
各位好,我想模拟蛋白大分子在加工过程中的结构变化,由于该蛋白结构至今没有完全解析,所以我想模拟部分片段的变化情况。已知的条件有蛋白二级结构,聚集情况,表面疏水基团等,再用modeller和pymol时发现并不能按 ...
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Pymol
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请教一个关于pymol软件的问题
顾我安稳
2019-1-3
新窗
各位大神,请教一个关于pymol软件的问题。 我在目的残基上标记出了polar contacts,但是,如何能显示出与目的残基有polar contacts的其它残基呢?我原来做过,可惜时间长忘记了(我记得不是一个个手工找的)。 感谢 ...
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图形可视化
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Pymol
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pymol还是免费软件吗?貌似官网上的在收费了
許你一世溫柔
2019-1-3
新窗
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图形可视化
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Pymol
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Vina对接的结果如何与目标蛋白分子保存在一个文件里以便...
空城依旧
2019-1-3
新窗
Autodock 4对接的结果(输出文件格式为xxx.dlg)可以用write complex功能与目标蛋白分子一起存成一个pdbqt文件,但Vina对接的结果(输出文件格式为xxx_vina.pdbqt)无法使用conformation里的write complex功能,那么该 ...
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图形可视化
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Pymol
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小白求助PDB中将蛋白与配体分开
貪戀妳的溫柔
2019-1-3
新窗
看了之前各位前辈的方法,尝试了以下: 1、首先试了用写字板打开PDB文件,然后删除HETATM内容,得到的蛋白在Autodock里打开,在加水分子这一步就显示“No new selection:::HOH*:*”。最后查看对接结果显示错 ...
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图形可视化
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Pymol
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MOE无法下载PDB数据问题
画成描眉
2019-1-3
新窗
各位术友,最近moe软件打开pdb数据库总是下载不了pdb文件(但是列表中能显示,说明网络连接没问题啊),显示的报错信息是:the following entry failed to download: XXXX(pdb代码),卸载了重新安装也不行,每次都 ...
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图形可视化
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Pymol
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pymol大神留下
暴走的短腿猫
2019-1-3
新窗
最近在学习一款软件叫pymol,全英文!都不知道怎么操作!有木有教程或者经验分享啊!
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图形可视化
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Pymol
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如何用pymol分析并得到蛋白突变后的结构
离别伊人憔
2019-1-3
新窗
各位大侠好,我是做蛋白定点突变的,已经突变了几个位点,想进一步分析一下这些突变是否造成蛋白结构的改变,突变前和突变后结构有何变化。但是我们实验室没有人做过结构这方面的东西,看了文献,有人用pymol分析, ...
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图形可视化
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Pymol
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PYMOL软件里面怎么计算两个芳香环之间的距离
鸢尾
2019-1-3
新窗
急急急,文章里面需要做这个图,奈何这个地方始终没整好。有谁知道这个问题怎么解决吗?感激不尽
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图形可视化
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Pymol
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求教:pharm mapper怎么提交不上去
浪者不回头
2019-1-3
新窗
因为课题内容需要,想用化合物反向对接一下,探索一下有无新的靶蛋白,但我用chemdraw,画完3D结构以后,又用pymol存的mol2格式,怎么submit第二步选完就提交不上,进行不下去???第一次用求大神指教?,谢谢 ...
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图形可视化
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Pymol
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PYMOL
眉间点砂
2019-1-3
新窗
哪个大神可以给一个PYMOL的安装包呀
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图形可视化
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Pymol
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pymol怎么给螺旋和折叠命名
假装无所谓
2019-1-3
新窗
pymol怎么给螺旋和折叠命名,螺旋从N端开始按照a1,a2,a3。。。,折叠从N端开始,从b1,b2,b3。。。。
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图形可视化
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Pymol
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pdb文件怎么读残基数..应该用什么软件计算比较简单呢
无人像你
2019-1-3
新窗
刚刚接触pymol,一头雾水_(:з」∠)_
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图形可视化
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Pymol
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使用Pymol处理了分子对接后的图,但是学校未购买软件
素年未逝
2019-1-3
新窗
使用Pymol处理了分子对接后的图,但是学校未购买软件 ,发文章可以用吗?求助。。 如果不能用,那要通过那种方式解决呢?
查看全文
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图形可视化
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Pymol
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pymol
南风知我意
2019-1-3
新窗
求蛋白质二级结构预测的pymol安装包以及步骤,急啊,帮帮忙哈,谢谢大家
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图形可视化
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Pymol
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pymol 旋转
把刀藏进衣袖
2019-1-3
新窗
怎样用pymol旋转蛋白的某一段,保持序列不变
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图形可视化
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Pymol
]
pymol使用求助
一婊人才
2019-1-3
新窗
在pymol中,氨基酸的label被氨基酸挡住,怎么移动label让它不被挡住呢
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图形可视化
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Pymol
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Pymol里怎么删除两个原子之间的键啊,万分感谢!!!
一念天堂
2019-1-3
新窗
如题,谢谢了
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图形可视化
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Pymol
]
安装autodock的pymol插件的详细方法
饿货不傻
2019-1-3
新窗
说在前面的话: 1. 如果你的电脑是Win10而且是64位的,建议你装个VMware虚拟机,虚拟个XP系统,对于最近几年的电脑来说几乎不会拖慢电脑速度。本虫是10年的电脑,开虚拟机依然流畅。为啥建议拖个XP呢?MGLtools上次 ...
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Pymol
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请问谁有pyMol教程和网页版docking教程?
帅的要命
2019-1-3
新窗
请问大家接触到新的软件去哪里找教程呢?哪个网站比较好用
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