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新窗
To sika3的短消息:msi2lmp工具的使用问题!
是一场戏
2018-11-19
新窗
不好意思可以请问你,MS导出的car和 mdf 文件转换为lammps的data文件,在msi2lmp中的例子你的过程如何执行的?? 答: 首先建议请先阅读msi2lmp中的README文件,readme文件中对该工具的使用已经说明的比较清楚了。如果 ...
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分子模拟
安装lammps报错
先生请自重
2018-11-19
新窗
在安装lammps时报错,报错如下: ../pair_kim.cpp:41:21: fatal error: KIM_API.h: No such file or directory compilation terminated. make[1]: *** Error 1 make[1]: Leaving directory `/home/zhsh/sourcecode/ ...
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2042
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分子模拟
关于displace_atoms
半粒糖甜到傷
2018-11-19
新窗
这是我结合几个帖子写的 #file name: in.c11 units metal boundary s s s atom_style atomic neighbor2.0 bin neigh_modifydelay 1 check yes lattice fcc 3.615 region box block 0 30 0 3 0 3 create_box 1 box ...
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分子模拟
lammps拉伸应力大好几个数量级
称兄道弟的男人
2018-11-19
新窗
应力应该是大概60GPa,到我这里都六次方GPa?是不是因为拉伸的过程太快,没有让它平衡导致的? 拉伸需要每拉一段距离,就运行几十万步让它平衡吗? 拉伸必须用nve系综吗?nvt系综可以吗? in文件如下,是单层石墨烯 ...
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分子模拟
关于LAMMPS位错建模
没网名用了
2018-11-19
新窗
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分子模拟
关于原子大小和氧、氮的lj势场参数问题
我在乎你的在乎
2018-11-19
新窗
有个问题想请教各位前辈,关于lammps里的原子半径设置问题,我在LAMMPS_short_manual中看到可以用shape命令来控制,但是在manual文件和lammps官网上都没找到这个命令,那么现在的lammps里是不是不能给原子设置半径大 ...
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1977
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分子模拟
关于软件lammps在mac上的安装使用问题
香草先生
2018-11-19
新窗
最近我在自学分子模拟软件lammps,但是在安装的过程中遇到了问题。 根据官网的指导(图片一)(http://lammps.sandia.gov/download.html#homebrew)我使用mac自带的terminal终端安装了homebrew,之后使用homebrew安 ...
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分子模拟
meam势函数参数修改和补充,谢谢关注
怀念你的爱
2018-11-19
新窗
我是用2NN做Cu-Si的,也是已知Cu,Si,Cu——Si这些meam参数。 可是问题在于: library.meam中Si和Cu给出参数与我要用的的各种参数有些不一致,想做一个修改和补充,我是再写一个Si.meam和Cu.meam还是直接在library ...
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分子模拟
速度相关函数
我笑她人看不穿
2018-11-19
新窗
这几天做了一下速度相关函数,很简单的一个东西,居然搞了3天。真是很郁闷。 不过要特别感谢剑心同学的大力和无私的帮助。同时也感谢mitbbs网上的一些讨论。 他用的是python,实在不懂,自己就编了一个c程序,通过ff ...
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分子模拟
有人使用SIESTA做MD模拟的吗?
情人总分分合合
2018-11-19
新窗
有没有人使用SIESTA做MD模拟的?我想请教一些问题
2006
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分子模拟
有lammps初学者用的小程序么 分享一下 谢谢诶
你浓我浓的梦
2018-11-19
新窗
衷心感谢
2021
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分子模拟
拉伸in文件的困惑
逃逃逃逃不掉
2018-11-19
新窗
我主要是想做TiAl 的拉伸,in文件中关于拉伸的部分是这样的: define groups region 1 block INF 1 INF INF INF INF group left region 1 region 2 block29 INF INF INF INF INF group right region 2 group ...
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分子模拟
多种势函数的应用
没有桃子的阿狸
2018-11-19
新窗
求教啊 我的系统里面就只有C原子,不过有3个type。1中原子之间,2中原子之间,3中原子之间还有1和2之间都是airebo势,1和3之间,2和3之间用lj/cut势。我的in文件是 pair_style hybrid airebo 3.0 1 1 lj/cut 3.0 pai ...
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分子模拟
有关displace_atoms命令的问题
失之永失
2018-11-19
新窗
displace_atoms upper rotate 0.0 0.0 151.0 0.0 0.0 5.0 1.0 units box 看不太懂,麻烦给讲一下这个命令吧,特别是units box前面的参数代表什么,哪个是有关角度的,谢谢!! ...
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分子模拟
关于region和compute temp/region
自欺欺人
2018-11-19
新窗
我定义了一些region 然后用compute temp/region来计算温度想问一下如果模拟过程中原子跑出了区域是不是就不算在计算温度之内了
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2017
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分子模拟
静态驰豫in文件-请帮忙看看对吗?谢谢
不给爷笑
2018-11-19
新窗
#Al system unitsmetal boundaryp p p atom_styleatomic read_dataAl-210-large5.lammps pair_styleeam/alloy pair_coeff* * Al.lammps.eam Al neighbor0.3 bin neigh_modifyevery 1 delay 5 check yes timestep0.00 ...
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分子模拟
一般驰豫模型的时候大概在什么温度合适呢
爱我者我必爱
2018-11-19
新窗
一般在模拟前都会先进行能量最小化,模型的驰豫。能量最小化与温度无关,但是一般对模型进行驰豫温度取多大比较合适呢?
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2010
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分子模拟
LAMMPS如何建立盒子里面装满水
迩若不离
2018-11-19
新窗
LAMMPS如何建立盒子里面装满水,本人新手,看教程发现没有一点思路?有大神推荐一下参考的吗
查看全文
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分子模拟
分子动力学模拟-驰豫过程
依赖太阳生存
2018-11-19
新窗
为什么驰豫过程,有的是从指定温度升到指定温度?而有的是从指定温度降到指定温度?例如,驰豫温度8,温度变化是从8开始下降到6度多或4多再升到8°平衡。而有模型是从8°升到100°再降到8°?? 谢谢 ...
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分子模拟
粒子沉积到表面的模拟
不分手的恋爱
2018-11-19
新窗
请教各位:我想用lammps模拟粒子沉积到表面,对于要沉积的粒子想沉积若干个,用哪个指令添加要沉积的粒子数目? 我用的fix1mobile deposit 300 1 100 12345 region mobile ,不能添加,麻烦各位指点一下我这个新手。 ...
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