极客首页
快捷导航
手机客户端
求知爱好者必备神器
极客问答客户端
Android版
iPhone版
更多
设为首页
收藏本站
|
绑定微信
登录
注册
首页
话题
导读
论坛
课堂
消费奖励
首页
论坛
签到
相册
提问
搜索
本版
文章
帖子
用户
每日签到
【建模仿真软件】
>
板块前沿新闻
matlab
COMSOL Multiphysics
LMS Virtual.Lab
ABAQUS
ANSYS--低频软件(Maxwell \PExprt\Rmxprt\Simplorer)
高频软件(HFSS\Designer \SIwave\DesignerSI)
MSC.ADAMS
Itasca
【计算模拟】
>
板块前沿新闻
Python
Materials studio
第一性原理
分子模拟
量子化学
分子对接
图形可视化
【学术分类】
>
生命科学
化学科学
医药科学
工程材料
【学术交流】
>
论文投稿
学术会议
论文翻译
【资源共享】
>
影视资源
电脑软件
课件资源
科研资料
科研工具
手机资源
资源求助
【休闲生活】
>
招聘信息布告栏
找工作
公务员考试
休闲灌水
术友互识
健康生活
职场人生
竞技体育
有奖起名
版主招聘,申请及离职
违规备案
最新新闻
极客学术-科研知识第一站
»
论坛
›
【计算模拟】
›
分子对接
RSS订阅
版块导航
【建模仿真软件】
板块前沿新闻
matlab
COMSOL Multiphysics
LMS Virtual.Lab
ABAQUS
ANSYS--低频软件(Maxwell \PExprt\Rmxprt\Simplorer)
高频软件(HFSS\Designer \SIwave\DesignerSI)
MSC.ADAMS
Itasca
【计算模拟】
板块前沿新闻
Python
Materials studio
第一性原理
分子模拟
量子化学
分子对接
图形可视化
【学术分类】
生命科学
化学科学
医药科学
工程材料
【学术交流】
论文投稿
学术会议
论文翻译
【资源共享】
影视资源
电脑软件
课件资源
科研资料
科研工具
手机资源
资源求助
【休闲生活】
招聘信息布告栏
找工作
公务员考试
休闲灌水
术友互识
健康生活
职场人生
竞技体育
有奖起名
版主招聘,申请及离职
违规备案
最新新闻
分子对接
+
发表话题
加关注
收起 ↑
最新
热门
热帖
精华
新窗
水分子要不要设置成柔性残基?
情感通缉犯
2018-12-4
新窗
我的配体和受体结合的时候,可以同时和一个水分子结合,在用autodock4做模拟结合的时候,要把这个水分子也设置为柔性残基吗?
查看全文
1894
3
0
0
分子对接
autodock重复实验结果不一样是为什么呢?
一身傲娇味儿
2018-12-4
新窗
如题,同一台电脑,同一个配体和受体,同样的条件,也就是说重复实验,为什么两次得到的binding energy等结果不是一样的呢?
查看全文
1721
1
0
0
分子对接
请问docking后,我想要计算RMSD值,
梦里清欢长
2018-12-4
新窗
请问docking后,我想要计算RMSD值,可是我的配体跟蛋白晶体里面的配体结构差别比较大,那是不是不适合计算RMSD值? 然后还有什么其他的方法评估我docking的结果呢? 刚来,没啥积分 ...
查看全文
1723
0
0
0
分子对接
autodock计算出错
听闻余生
2018-12-4
新窗
我还想一下: 我在运行 run autodock时,会出错误。提示是:too few values read in check grid map'a' 还有error:error in readmap unsuccessful completion 这些提示都是关于autodock4的,而在运行autogrid ...
查看全文
1925
2
0
0
分子对接
不同电脑对autodock结果是否有影响?
凉城温酒
2018-12-4
新窗
autodock在不同电脑上做同一个模拟结合,结果会不会不致? 或者这样问,同样的模拟条件,不同的电脑,除了运算时间不同外,对实验结果本身有影响吗?
查看全文
1837
3
0
0
分子对接
配体是选ZINC数据库还是PDB文件上的?
迷人的混蛋
2018-12-4
新窗
我的PDB文件中有受体和配体,用autodock做模拟结合时,配体是选这个PDB中的,还是从zinc数据库上下载?二者有什么差异吗? 另外,如果从PDB上取配体,用autodock给配体加氢时,会把一些N原子也加上氢,但这些N原子是 ...
查看全文
1714
2
0
0
分子对接
给分子加氢报错
感情废物
2018-12-4
新窗
我从protein bank 里下了个微管蛋白,在autodock中删除水后进行加氢,它提示含有未成键源自,我把这些原子删除后重新加氢,然后就出现p'ython报错,不知道为什么,求大神指教 ...
查看全文
1736
1
0
0
分子对接
蛋白质为核磁共振(NMR)解析,能否对接?
非洲小白脸
2018-12-4
新窗
如题,请问蛋白质为核磁共振(NMR)解析,能否对接?
2195
3
0
0
分子对接
AutoDock中如何添加atom type
爺们狠有范
2018-12-4
新窗
在AutoDock中如何添加atom type。求详细过程,脚本编辑方法。
1860
4
0
0
分子对接
求推荐分子模拟对接的学习材料
他是命却似梦
2018-12-4
新窗
开始着手做分子对接相关方面的实验有一段时间了,但大多是自己捣鼓,也不是很高级的操作。看文献的时候碰到一些专业术语要费好大的劲儿才能弄明白,大家很多都比我开始的早,也更专业,能否推荐一些计算机模拟方面的 ...
查看全文
1878
3
0
0
分子对接
大家都是怎么从Autodock上得到一些比较好看的对接图的?
命里缺你
2018-12-4
新窗
使用Autodock有一段时间了,常在别人的论文里看到一些对接图,我都是用笨办法直接抠图,不知道大家都怎么弄的? 还有个问题是当配体和受体同时显示在图形界面时,他们的相对位置是随便放的,还是软件经过计算的? ...
查看全文
2267
2
0
0
分子对接
将柔性残基的坐标与骨架坐标合并
听风暖
2018-12-4
新窗
将柔性残基的坐标与骨架坐标合并
1687
2
0
0
分子对接
Autodock分子对接问题请教
戎马书生
2018-12-4
新窗
要对接的蛋白质含有辅酶磷酸吡哆醛(PLP),首先需要PLP与蛋白质中的lys180残基形成共价键,然后再和底物对接,请教在autodock中该怎样设定使lys与PLP形成共价键?谢谢! ...
查看全文
1705
2
0
0
分子对接
真心求懂得学长学姐求教autodock软件
滴墨成殇
2018-12-4
新窗
因为要用到autodock软件,但本人完全看不懂,求求各位懂的学长学姐教一教,真心请求了。
1842
0
0
0
分子对接
Mac下使用lefrag简介
顾我安稳
2018-12-4
新窗
Lefrag也是一个很强大的工具。今天在找老师指点下用了一下。简单介绍一下。方便初学者。 1.去lephar网站下载lefrag mac,放到应用程序里的ledock文件夹(自建),改名为ledock 2. 打开终端,用cd命令进入 cd /Appli ...
查看全文
1724
0
0
0
分子对接
mac下使用ledock报错
許你一世溫柔
2018-12-4
新窗
在Mac os 10.11的终端中使用ledock。结果报错:libc++abi.dylib: terminating with uncaught exception of type std::length_error: vector 求解决办法。多谢
查看全文
1716
0
0
0
分子对接
Dock活性位点不确定的对接
貪戀妳的溫柔
2018-12-4
新窗
在蛋白质与抑制剂对接时,从文献中得知结合部位的大致位置(某几个氨基酸附近),在对接时用最大簇,对接后的位置与文献中的位置不一样,是不是要换其他簇? 还有就是之前可以用RMSD来衡量对接部位的好坏,这里没有 ...
查看全文
2611
1
0
0
分子对接
GOLD打分函数
画成描眉
2018-12-4
新窗
请问哈,谁有GOLD打分函数的中文版解释?谢谢
1689
2
0
0
分子对接
The _imaging C module is not installed
眉间点砂
2018-12-4
新窗
The _imaging C module is not installed 在Ubuntu下没有这个模板,autodock不能处理?请问你们是怎么解决的?
查看全文
1684
0
0
0
分子对接
AutoDock Tools在Ubuntu Kylin14、Ubuntu Kylin15下安装的详细步骤
浪者不回头
2018-12-4
新窗
Ubuntu Kylin14、Ubuntu Kylin15下安装:1. Home文件夹即主文件夹下新建一个文件夹autodock(文件夹可以自己随意新建设置);登11.mgltools官网,下载mgltools_x86_64Linux2_1.5.6.tar.gz(下载符合电脑硬件的 ...
查看全文
1663
2
0
0
分子对接
1
2
3
4
5
6
7
8
/ 8 页
下一页
选择主题分类
求助
资源
交流
还可输入
80
个字符
# 高级模式 #
您需要登录后才可以发帖
登录
|
立即注册
B
Color
Image
Link
Quote
Code
Smilies
发表帖子
Archiver
|
手机版
|
小黑屋
|
极客学术
|
京ICP备16066145号-3
Powered by
Discuz!
X3.4
© 2014-2020
Comsenz Inc.
返回版块
返回顶部