疯不觉 发表于 2020-5-13 15:52:06

分子对接，在pymol中形成pdb复合物后，查看相互作用力问题（氢键

使用Autodock vina做完对接后，导入pymol软件查看配体与蛋白的氢键作用，按照教程说的find-polar contacts-to other atoms in objects,却没有显示除氢键。但是直接导入原配体蛋白又可以显示氢键关系，请问有人知道如何处理该问题么？我在对接前处理蛋白，加的是全氢，不是极性氢，有关系么？

geeksci 发表于 2020-5-13 15:54:09

首先确定后对接后一定有氢键吗？一些化合物不容易成氢键
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