离别伊人憔 发表于 2019-1-3 14:56:44

如何用pymol分析并得到蛋白突变后的结构

各位大侠好,我是做蛋白定点突变的,已经突变了几个位点,想进一步分析一下这些突变是否造成蛋白结构的改变,突变前和突变后结构有何变化。但是我们实验室没有人做过结构这方面的东西,看了文献,有人用pymol分析,想请教一下各位大神具体怎么用这个软件?请各位大神赐教,谢谢啦,另外,可不可以上次一份这个软件的安装包?捉急中.....

鸢尾 发表于 2019-1-3 15:05:09

通常突变几个氨基酸不至于造成蛋白质结构的改变。但突变位点及其周围会有一定改变及性质变化。从而可能影响其活性。
pymol是不错的分子显示软件,(搭配插件)也能做一些简单的分析。但不足以满足你想要做的事(可以做突变,但难以做突变后的结构优化等)。
pymol小木虫有人上传过,搜索一下应该可以找到的。

暴走的短腿猫 发表于 2019-1-3 15:05:27

下载一下直接安装就可以,先安装python语言,然后安装pymol,免费软件,很好的可视化界面,操作简单

离别伊人憔 发表于 2019-1-3 15:05:37

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