软肋是你 发表于 2019-1-3 11:45:52

Pymol在选择Ca时 defined with 0 atoms.”怎么办呢？

Pymol在选择Ca时“select carbon, name ca”总显示“Selector: selection "carbon" defined with 0 atoms.”怎么办呢？

旧人不归 发表于 2019-1-3 11:46:04

确定sequence中的name为ca？或者不用输代码，直接在sequence中选择，其为单独的一个sele，然后把该sele重命名为ca，在该sele中进行鼠标操作就可以了

软肋是你 发表于 2019-1-3 11:46:10

一个蛋白，四百多氨基酸，难不成都一个一个点啊？又没有快选的呢

软肋是你 发表于 2019-1-3 11:46:27

这个Ca是α碳，不是钙

旧人不归 发表于 2019-1-3 11:46:35

用word打开pdb，看看pdb中的名字是什么！
ATOM   96CACYS A15      21.565   7.33547.7311.00 21.92         C
ATOM   97C   CYS A15      21.715   6.43146.5041.00 21.98         C
ATOM   98O   CYS A15      21.085   5.38146.5611.00 22.66         O
ATOM   99CBCYS A15      20.398   8.30247.4681.00 21.17         C
ATOM    100SGCYS A15      20.846   9.58546.2691.00 21.78         S
ATOM    101N   ALA A16      22.540   6.75345.4951.00 22.13         N
ATOM    102CAALA A16      22.738   5.97244.2941.00 21.96         C
ATOM    103C   ALA A16      21.520   5.21643.8081.00 22.74         C
ATOM    104O   ALA A16      21.412   3.98243.8301.00 22.78         O
比如上面的确实是CA，则可以select carbon, name ca或者select atom, name ca，这样都可以选择你需要的α-C，要以pdb中的为准

软肋是你 发表于 2019-1-3 11:47:10

谢谢！
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