MS中discover模块.xtd文件转化xyz坐标
通过程序直接一次生成所有的xyz坐标,即各个模拟步数的坐标都有。具体操作:1.将下载的ms2xyz.pl,用文本打开,把文本中的my $doc = $Documents{"./
benzene
.xtd"}; 用红色标出的部分改成你需要转化的.xtd文件名;
2.ms2xyz.pl 文件导入到你需要转化.xtd文件的目录下;
3.并且打开ms2xyz.pl ,程序代码处于当前的激活状态;
4. 在MS的菜单下,选择tools-scripting-debug,程序自动开始转化.xtd文件的所有坐标,根据坐标的数量不一样,需要的时间也不一样。
5.执行完成后,系统会提示执行了多少个模拟步数,就是设置的模拟步数;最后会有一个trj.txt文本生成。就在.xtd的同一目录。
http://hi.baidu.com/sobereva/item/68b2d2866c0223ebe596e0c6 学习学习。 下载下来的东西怎么没有my $doc = $Documents{"./benzene.xtd"这个东西 我想问下大家怎么只取某一个原子的远动坐标?求交流! MS新手,也想知道该怎么输出单个原子的运动轨迹,问题解决了吗? :L:L:L:L:L
页:
[1]