奈何桥上 发表于 2018-11-28 14:43:15

PMEMD.cuda不能用FIND和SEARCH

发现:PMEMD.cuda不能用FIND和SEARCH,会报:Segmentation fault
Restrain mslo backbone minimization
500.0
FIND
CA * * *
SEARCH
RES 1 376
END
END
即上面几行不能用,但pmemd就没事的。
可是就慢了不少!

东京樱花 发表于 2018-11-28 14:43:30

我也遇到和你一样的问题,在amber官方的maillist里面:http://archive.ambermd.org/201010/0027.html, Ross Walker说这是一个bug,但我用最新的bugfix.all打上重新编译后,问题仍未解决,,不知道你的问题解决了没有?欢迎指教。

奈何桥上 发表于 2018-11-28 14:43:45

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