Materials Studio分子模拟软件——能量最优化
本期小编将为大家介绍如何使得煤的化学结构模型整体能量最小。1. 以甲烷分子为例，绘制一个甲烷分子（灰色为C原子，白色为H原子）。通过上期的介绍大家可以自行查询绘制好的分子的基本信息。2. 在菜单栏中选择Forcite板块，选择Calculation，弹出对话框Forcite Calculation，Task选择“Geometry Optimization”，精度可根据自己需求选择。点击右侧More可调节相关参数，算法选择共轭梯度法（Conjugate gradient）。3. 点击Energy，选择适合的力场后，点击Run开始运行。4. 运行完成后，可在左侧窗口看见几何优化后的文件夹，如图，可从相关文件中查看分子结构数据。5. 几何优化结束后双击文件夹中的.xsd文件，进行退火优化。仍旧在Forcite板块，Task选择Anneal，对其参数进行调节，不同的是在Forcite Anneal Dynamics弹窗中点击More对Ensemble进行修改，选择合适的系综进行优化。6. 选择合适的系综后点击Advanced标签，勾选“Include forces”。7. 上述参数设置完毕后，点击Energy，力场需与几何优化步骤的力场保持一致，最后点击Run运行。8. 运行完成后即可获得如图所示的文件夹，到此就可使得分子的化学结构模型整体能量最小。
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